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（1）①根据杂交结果，长翅：残翅=3：1，判断在长翅和残翅一对相对性状中，显性性状是长翅．由于红眼与白眼和长翅与残翅都是一对基因控制的相对性状，所以在遗传中都遵循基因的分离定律．
②由于在雌果蝇和雄果蝇中，长翅：残翅都是3：1，说明基因位于常染色体上，亲代翅形的基因型都是Aa；又红眼对白眼显性，基因位于X染色体上，而杂交后代中，雌果蝇中无白眼，雄果蝇中红眼：白眼=1：1，所以亲代眼色的基因型是XBY和XBXb．因此，亲本果蝇的基因型分别是AaXBY和AaXBXb．
（2）①由于黑身由隐性基因控制，因此可让此黑身雄果蝇与原种群中的灰身雌果蝇杂交，得到子一代，子一代的表现型为全部灰身．再将子一代雌雄果蝇彼此交配，观察其后代的表现型．
②如果后代表现型为雌果蝇全部为灰身，而雄果蝇灰身和黑身都有，说明有性别之分，那么黑身基因就应位于X染色体上．如果雌果蝇和雄果蝇都有灰身和黑身，那么黑身基因就应位于常染色体上．
故答案为：
（1）①长翅 红眼与白眼和长翅与残翅
②AaXBY AaXBXb
（2）①全部灰身雌雄果蝇彼此交配
②雌果蝇全部为灰身，雄果蝇灰身和黑身都有，比例约为1：1
果蝇中，红眼基因（A）与白眼基因（a）位于X染色体上，长翅基因（B）与残翅基因（b）位于常染色体上．现
（1）据图分析可知：1号染色体上为E基因，控制果蝇眼睛的颜色为红眼，3号染色体上为B基因，控制果蝇眼睛的形状为细眼，故果蝇M眼睛的表现型是红眼细眼，由于控制眼睛颜色的基因位于X染色体上，该果蝇为雄性基因型为XEY，与另一雌果蝇杂交，由子代的雄果蝇既有红眼XEY又有白眼XeY可知，该雌性个体能产生XE、Xe两种类型的配子，故该雌果蝇的基因型为XEXe．
（2）果蝇M产生配子时，由于Bb和Vv两对等位基因位于同一对同源染色体上，故不遵循基因的自由组合定律，且Bv、bV连锁遗传，M只能产生Bv、bV两种比例相等的配子，即测交后代的基因型及表现型为Bbvv残翅细眼：bbVv长翅粗眼=1：1．
（3）只看体色这一对基因，果蝇M为RR与黑身rr果蝇杂交，后代理论上应全为Rr的灰身，却出现了一只黑身果蝇，可能有以下两种情况：①基因突变，则该黑身果蝇的基因型为rr，②染色体缺失，则该果蝇的基因型可用r0表示，0表示染色体上缺失该基因，如果选用rr的个体进行实验，则后代全为rr或r0的黑身分不清属于哪种情况，故应选择提供的Rr个体进行实验．
Ⅰ．如为基因突变，则亲本为rr×Rr，F1为
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Ⅱ．如为染色体缺失，则亲代为r0×Rr，F1未出现00缺失死亡个体，F1自由交配产生F2，符合遗传平衡定律，亲代中基因频率与F1相同，为R=0=
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（4）根据题干信息可知，此种群符合遗传平衡定律，由F1中灰身果蝇8400只，黑身果蝇1600只可知：rr的基因型频率为16%，可推出r=40%，R=60%，Rr=2×40%×60%=48%．
故答案为：
（1）红眼细眼 XEXe
（2）不遵循 两对等位基因位于同一对同源染色体上? 长翅粗眼：残翅细眼=1：1
（3）①Rr
②I、灰身：黑身=7：9? II、灰身：黑身=7：8
（4）40%；48%
（1）分析表格中的信息可知，长翅果蝇与长翅果蝇交配后代的长翅：残翅=3：1，因此亲代果蝇的基因型为Bb×Bb；红眼果蝇与红眼果蝇交配，后代中雌果蝇全是红眼，雄果蝇中红眼与白眼之比是1：1，因此亲本果蝇的基因型为XAXa×XAY，因此对于两对相对性状来说，亲本雄性的基因型是BbXAY，雌性的基因型是BbXAXa．
（2）雌性亲本进行减数分裂产生正常卵细胞中，B、b与A、a发生自由组合形成的卵细胞的基因型为BXA、BXa、bXA、bXa四种．
（3）雄性亲本的基因型为BbBAY，与bbXaXa的雌性个体进行测交实验，侧交后代的基因型为BbXAXa、BbXaY、bbXAXa、bbXaY，比例是1：1：1：1，其中红眼长翅的个体的基因型为BbXAXa，占
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故答案为：
（1）BbXAYBb?XAXa?
（2）B或b
（3）
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